Lo mejor realmente para generar payloads es crearlos tu mismo ya que sabes exactamente lo que hace el código y como se ejecuta.
https://github.com/Veil-Framework/Veil
Además de ser muy conocido por generar exploits que hacen bypass de antivirus en los que se basan otros frameworks como FatRat.
Lo malo es que es muy detectado porque no es actualizado.
https://github.com/ParrotSec/shellter